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5月31日,國際學(xué)術(shù)期刊Stem Cell Reports在線(xiàn)發(fā)表了中國科學(xué)院上海營(yíng)養與健康研究院丁秋蓉與邵振研究組的合作研究成果“Genetic and chemical screenings identify HDAC3 as a key regulator in hepatic differentiation of human pluripotent stem cells”。該研究通過(guò)大規模遺傳篩選和化合物篩選鑒定出包括組蛋白去乙酰化酶HDAC3等在內的人多能干細胞(human pluripotent stem cells, hPSCs)體外肝向分化關(guān)鍵調控因子。

人多能干細胞體外定向分化來(lái)源的肝臟樣細胞(hepatocyte like cells, HLCs)是肝臟疾病模擬、毒理檢測以及肝臟移植供體的潛在重要細胞來(lái)源。但目前得到的HLCs普遍存在成熟度不夠、純度不夠的問(wèn)題,限制了其在基礎科學(xué)和轉化醫學(xué)方面的應用。

為進(jìn)一步優(yōu)化體外定向分化體系,促進(jìn)肝臟細胞的成熟和均一化,博士研究生李爽等人在肝臟成熟標志物白蛋白(ALB)終止密碼子前定點(diǎn)敲入綠色熒光蛋白(Venus)表達框,建立了成熟肝臟譜系標記的人多能干細胞報告株。并在此基礎上,運用CRISPR全基因組敲除慢病毒文庫,進(jìn)行了大規模遺傳篩選,鑒定出ATG7, RPS6KA2, HDAC3等若干基因參與調節人多能干細胞體外肝向分化。同時(shí)根據篩選出的調節基因及其相關(guān)功能提示,進(jìn)一步進(jìn)行了有針對性的化合物文庫篩選,發(fā)現一個(gè)組蛋白去乙酰化酶小分子抑制劑CI-994能顯著(zhù)促進(jìn)HLCs的定向分化;并發(fā)現該小分子同樣能抑制原代肝臟細胞體外培養過(guò)程中肝臟屬性的快速丟失。全基因組敲除慢病毒文庫篩選和小分子化合物庫篩選都證實(shí)了組蛋白去乙酰化酶HDAC3是肝臟分化的重要調控因子,進(jìn)一步的研究發(fā)現HDAC3可以與肝臟譜系關(guān)鍵轉錄因子HNF4等結合共同調節肝臟細胞分化過(guò)程。

本研究綜合運用報告基因細胞株、大規模遺傳篩選以及化合物篩選,建立了一個(gè)高效的體外細胞實(shí)驗體系,用于研究人多能干細胞的肝臟細胞體外定向分化過(guò)程,也為研究和優(yōu)化hPSCs向其他類(lèi)型的細胞分化提供了一種普適而有效的方法。

本研究由博士研究生李爽、研究助理李木山等在丁秋蓉研究員、邵振研究員和趙永旭博士的指導下完成,也得到了中國科學(xué)院上海營(yíng)養與健康研究院(暫名)應浩、方靖和王慧研究員,美國賓夕法尼亞大學(xué)Kiran Musunuru教授,東莞理工大學(xué)馬丹軍教授的幫助。同時(shí),本研究得到了國家重點(diǎn)研發(fā)計劃、中科院干細胞先導、國家自然科學(xué)基金委等項目的共同資助以及上海營(yíng)養與健康院公共技術(shù)平臺的支持。

原文鏈接:https://doi.org/10.1016/j.stemcr.2018.05.001


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