報告題目: EGPS 1.0: Comprehensive software for multi-omic and evolutionary analyses
報告人: 李海鵬研究員
中科院計算生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗室
時(shí) 間: 9月18日（周三）16：00
地 點(diǎn): 岳陽(yáng)路319號信息中心明德廳
摘 要：
組學(xué)數據爆發(fā)性增長(cháng)，而對數據的高效挖掘和深度分析卻成為生物學(xué)家面臨的難題。我們開(kāi)發(fā)了針對生物進(jìn)化和多組學(xué)分析的綜合軟件eGPS（evolutionary Genotype-Phenotype Systems），極大方便了相關(guān)分析。eGPS軟件包括單機版本和云計算版本，可在不同平臺下運行，且利于開(kāi)發(fā)，易于應用。云計算版本將基因組分析、群體數據分析、進(jìn)化數據分析、網(wǎng)絡(luò )分析以及圖形可視化這五部分的分析有機整合起來(lái)，實(shí)現遠程云計算功能，方便用戶(hù)在缺乏計算資源的情況下快速獲得運算結果，并最終以圖形、圖表等形式直觀(guān)展示。單機版本可以在無(wú)須上傳數據的情況下，幫助用戶(hù)分析基因組學(xué)、轉錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的數據。同時(shí)eGPS Desktop還擁有完善的進(jìn)化分析流程。比如可以直接從基因組序列比對建立物種樹(shù)。在eGPS Cloud和其他開(kāi)放式在線(xiàn)資源的支持下，eGPS Desktop提供了一鍵點(diǎn)擊從候選基因到基因樹(shù)的分析流程。相關(guān)程序可從http://www.egps-software.org/免費獲取。
個(gè)人簡(jiǎn)介：
李海鵬，進(jìn)化基因組學(xué)研究組PI，從事理論群體遺傳學(xué)、生物信息學(xué)、進(jìn)化生物學(xué)的研究。
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