中國科學(xué)院上海營(yíng)養與健康研究所所級科學(xué)數據中心于12月5日下午舉辦了“人體微生物組大數據分析進(jìn)階”培訓，旨在幫助科研人員了解人體微生物組研究的最新發(fā)展和應用，并快速掌握常用的分析技術(shù)和方法。本次培訓由中心資深工程師李強擔任主講人，他在人體微生物組數據分析和可視化方面具備豐富的實(shí)踐經(jīng)驗和專(zhuān)業(yè)知識。
李強首先回顧了上次人體微生物組數據分析和可視化入門(mén)培訓課程的主要內容。隨后，他詳細介紹了iMAC宏基因組數據分析流程，并通過(guò)示意圖展示了如何對宏基因組數據進(jìn)行分析，使學(xué)員們更直觀(guān)地理解該流程。此外，他還介紹了MetaPhlAn4、Kraken套件等工具，并深入探討了從菌群基因層面挖掘人腸道菌群的“指紋”和影響健康的機制，以及冰川微生物基因組研究等相關(guān)內容。最后，他通過(guò)實(shí)際操作演示了iMAC平臺的數據分析過(guò)程，包括數據背景、測序準備工作、使用iMAC平臺進(jìn)行分析、生成結果文件、數據質(zhì)控、結果解讀、序列比對注釋、功能注釋、代謝物預測、VF \ ARF豐度計算等環(huán)節。學(xué)員們積極參與，踴躍發(fā)言，并進(jìn)行了深入的交流和討論。
通過(guò)本次培訓，學(xué)員們更加熟悉了iMAC微生物組學(xué)分析平臺的使用，包括微生物組數據分析參數解析和任務(wù)提交管理，以及如何解讀分析結果等。這將使學(xué)員們更深入了解所級科學(xué)數據中心提供的常規生物信息分析服務(wù)，并為科學(xué)研究提供有力支持。
營(yíng)養與健康所所級科學(xué)數據中心將繼續舉辦相關(guān)主題的培訓活動(dòng)，以幫助更多的科研人員掌握生信常規分析等服務(wù)。同時(shí)，所級科學(xué)數據中心也歡迎科研人員提出寶貴意見(jiàn)和建議，以進(jìn)一步完善和提升服務(wù)質(zhì)量。
李強工程師作培訓報告
官方微信
