中國科學(xué)院上海營(yíng)養與健康研究所生物醫學(xué)大數據中心于2016年3月正式組建成立。為了將生物醫學(xué)大數據面向國家及社會(huì )的工程化服務(wù)與面向科學(xué)技術(shù)前沿的創(chuàng )新研究有機結合，中心依托上海生物醫學(xué)大數據工程技術(shù)研究中心，組建了由研究員、工程師、博士后構成的青年創(chuàng )新團隊，投入面向生物醫學(xué)創(chuàng )新發(fā)展的生物醫學(xué)大數據基礎建設工作，積極推進(jìn)生物醫學(xué)大數據在人群隊列、精準醫學(xué)、表型組、微生物學(xué)等方面的數據體系、分析體系和應用體系的建設。
研究所與團隊簡(jiǎn)介
中國科學(xué)院上海營(yíng)養與健康研究所（以下簡(jiǎn)稱(chēng)“營(yíng)養與健康所”）系根據中國科學(xué)院深化上海生命科學(xué)研究院改革決策部署，于2016年底整合組建的獨立事業(yè)法人研究機構。營(yíng)養與健康所面向人民生命健康，圍繞“健康中國”戰略、積極應對人口老齡化國家戰略，聚焦“重大慢病防控與老齡健康促進(jìn)”科技戰略重點(diǎn)，打造國際知名的健康科學(xué)與技術(shù)機構、科技智庫和健康產(chǎn)業(yè)促進(jìn)中心。
營(yíng)養與健康所“十四五”期間生物醫學(xué)大數據重大科技任務(wù)團隊由張國慶研究員、王澤峰研究員、李海鵬研究員、高瑩研究員、黃濤青年研究員五個(gè)研究組聯(lián)合組建而成，張國慶任重大科技任務(wù)首席科學(xué)家，并邀請趙國屏院士、李亦學(xué)研究員等資深專(zhuān)家作為團隊指導專(zhuān)家。團隊擁有10PB級別的生命組學(xué)數據資源和文獻資源，30 PB存儲、250臺高性能服務(wù)器（其中TB級超大內存服務(wù)器15臺）集群組成的計算資源一體化環(huán)境，通過(guò)https://www.biosino.org/ 提供對外服務(wù)。團隊研究成果發(fā)表在Cell、Cell Research、Mol Cell、Cancer Cell、Nature Microbiology、Nature Methods、Nature Communications、Nucleic Acids Research、National Science Review、Briefings in Bioinformatics、Science Bulletin、American Journal of Clinical Nutrition等國際學(xué)術(shù)期刊。
研究?jì)热荩荷镝t學(xué)大數據重大科技任務(wù)團隊聚焦生命組學(xué)與健康醫學(xué)大數據驅動(dòng)的知識發(fā)現過(guò)程中的核心技術(shù)，圍繞核心數據資源匯聚、多模態(tài)數據管理、多組學(xué)數據整合分析、健康醫學(xué)數據治理、知識圖譜構建等技術(shù)問(wèn)題，開(kāi)展系統生物學(xué)算法/軟件/流程研發(fā)、人群隊列/腫瘤等復雜慢性疾病知識發(fā)現研究，并推動(dòng)在人口健康和臨床轉化應用。
研究團隊根據目前的發(fā)展需要，現面向國內外招聘生物信息學(xué)研究方向的副研究員或助理研究員和博士后2名，數據科學(xué)研究方向的副研究員或助理研究員和博士后2名，誠摯邀請具有相關(guān)學(xué)科背景的優(yōu)秀青年學(xué)者加入。
一、研究方向
應聘者任選一研究方向即可。
研究方向1：醫學(xué)信息的自然語(yǔ)言處理、數據治理和知識圖譜等關(guān)鍵技術(shù)的研究與應用。
研究方向2：生物醫學(xué)文獻的自然語(yǔ)言處理、知識圖譜和海量數據可視化。
研究方向3：多組學(xué)數據分析及其在臨床及基礎研究中的應用。
研究方向4：時(shí)空轉錄組數據分析與應用。
二、應聘要求：
1. 具有生物信息學(xué)、生物醫學(xué)數據治理、知識圖譜、人工智能、流行病學(xué)等相關(guān)科研經(jīng)驗；副研究員或助理研究員要求有至少2年博士后工作經(jīng)歷;博士后要求獲得博士學(xué)位時(shí)間不超過(guò)3年。
2. 應聘博士后人員應屆博士畢業(yè)生優(yōu)先；以第一作者（含并列）在領(lǐng)域核心學(xué)術(shù)期刊、會(huì )議發(fā)表過(guò)研究論文者優(yōu)先，或取得研究相關(guān)的專(zhuān)利的主要發(fā)明人優(yōu)先。
3. 本人有強烈科研意愿，希望能夠做出重要原創(chuàng )性技術(shù)突破。具備獨立開(kāi)展科研工作能力，具有良好團隊合作精神、良好的溝通交流能力及較強的中英文交流寫(xiě)作能力。
三、福利待遇
1. 按照營(yíng)養與健康所的規定，提供極具競爭力的薪酬待遇及良好的個(gè)人職業(yè)發(fā)展平臺，積極支持其崗位晉升和待遇提升。
2. 享受上海市相關(guān)社會(huì )保險、住房公積金等待遇，根據國家及上海市相關(guān)政策協(xié)助辦理人才落戶(hù)等。
3. 大力支持申報國家及上海市各類(lèi)基金項目，以及中科院特別研究助理資助項目、青促會(huì )項目、中科院引才計劃等項目。
4. 支持參加高水平國內外會(huì )議。博士后入站后將納入中科院特別研究助理崗位管理。
四、招聘方式及程序
1. 報名截止時(shí)間
長(cháng)期有效，招滿(mǎn)為止。
2. 應聘者須提供以下應聘材料
（1）個(gè)人簡(jiǎn)歷（教育經(jīng)歷、工作經(jīng)歷、發(fā)表論文、榮譽(yù)獎勵等）；
（2）有關(guān)證明材料：身份證、學(xué)歷及學(xué)位證書(shū)（學(xué)歷學(xué)位必須在學(xué)信網(wǎng)可查詢(xún)驗證）、相關(guān)資格證書(shū)、獲獎證書(shū)等；
（3）第一作者/共同第一作者的論文全文以及其他應聘者認為重要的書(shū)面材料。
五、聯(lián)系方式
有意向者，請將上述材料的電子版發(fā)至lujian@picb.ac.cn（請在應聘材料和郵件主題欄注明應聘崗位和姓名，按如下格式：“姓名－應聘崗位”）。初審合格后，我們將盡快通知面試，擇優(yōu)錄用。謝絕來(lái)電來(lái)訪(fǎng)，應聘材料恕不退還，本單位將予以保密。
團隊科學(xué)家簡(jiǎn)介
趙國屏院士，分子微生物學(xué)家，中國科學(xué)院院士，第三世界科學(xué)院院士，美國微生物科學(xué)院院士。多年從事微生物生理生化、代謝調控及酶作用機理的研究。參與組織中國人類(lèi)基因組計劃，建立基因組學(xué)研究平臺；啟動(dòng)生物芯片、生物信息學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)研究工作。在微生物基因組、代謝酶乙酰化組、腸道微生物組研究方面，做出開(kāi)創(chuàng )性工作。開(kāi)拓系統合成生物學(xué)研究領(lǐng)域，在天然化合物人工細胞工廠(chǎng)合成、單染色體酵母構建與CRISPR-Dx體系創(chuàng )建方面作出基礎性貢獻。
李亦學(xué)研究員，生物信息學(xué)專(zhuān)家。長(cháng)期致力于生物信息學(xué)理論創(chuàng )新與應用，取得開(kāi)拓和系統性成果。在計算生物學(xué)理論方法與生命組學(xué)的融合方面，基于群體遺傳和進(jìn)化原理，建立錨定蘊含關(guān)鍵遺傳信息的“Sweep”區域新計算模型，開(kāi)展SARS、狼、狗、駱駝、蝎子和新冠病毒的比較和功能基因組研究，相關(guān)工作發(fā)表在Genome，Res. Mol. Biol. Evol.，Nature Comm.，Bioinformatics、Mol. Sys. Biol.，Nucle. Acids Res.，Oncogene等雜志，被Nature和Science雜志頭版報道評述，獲2020年中國十大生物信息學(xué)研究進(jìn)展。在計算生物學(xué)理論方法與基因編輯技術(shù)的融合方面，建立不依賴(lài)基因編輯技術(shù)體系和編輯位點(diǎn)特殊性深度學(xué)習算法，相關(guān)工作發(fā)表在Science，Nature，Nature Method，Cell Stem Cell， Nature Rev Gastro&Hepat，Nature Sci. Rev.等雜志，獲2019年“中國生命科學(xué)十大進(jìn)展”。詳細情況介紹請參考http://www.sinh.cas.cn/rcdw/kzyjy/201803/t20180327_4986743.html。
張國慶研究員，從事生物醫學(xué)大數據管理體系與知識圖譜研究，中國遺傳學(xué)會(huì )生物大數據專(zhuān)業(yè)委員會(huì )委員，中國醫藥生物技術(shù)協(xié)會(huì )生物醫學(xué)信息技術(shù)分會(huì )委員。相關(guān)研究得到國家重點(diǎn)研發(fā)計劃、基金委國家重大科研儀器研制項目（部門(mén)推薦）、中國科學(xué)院戰略性先導科技專(zhuān)項（B 類(lèi)）、上海市市級科技重大專(zhuān)項等國家和上海市的重大重點(diǎn)項目資助。詳細情況介紹請參考http://www.sinh.cas.cn/rcdw/qtbssds/202203/t20220311_6388137.html ；近期研究論文詳見(jiàn) https://orcid.org/0000-0001-8827-7546 。
王澤峰研究員，中科院計算生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗室主任。長(cháng)期從事RNA系統生物學(xué)研究及相關(guān)技術(shù)研發(fā)，包括RNA可變剪接的調控；環(huán)形RNA的非典型翻譯及其生理功能；設計人工RNA結合蛋白質(zhì)來(lái)操控RNA。2014年在國際上首次發(fā)現環(huán)形RNA可進(jìn)行翻譯來(lái)合成蛋白，并系統性鑒定了非典型RNA翻譯調控元件，開(kāi)創(chuàng )了環(huán)形RNA作為新一代mRNA療法的應用。于Cell，Mol Cell, Cancer Cell, Nat Struct Mol Biol, Cell Research, Nat Methods, Nature Communications, PNAS, eLife等核心雜志發(fā)表論文70余篇并被廣泛引用。獲多項國際國內獎勵。受邀任科學(xué)通報，JMCB，BBA advance副主編和多個(gè)學(xué)術(shù)期刊編委。詳細情況介紹請參考http://www.sinh.cas.cn/rcdw/qtyjzz/201803/t20180327_4986754.html。
李海鵬研究員，長(cháng)期致力于發(fā)展進(jìn)化理論，解決關(guān)鍵生物學(xué)問(wèn)題，發(fā)表SCI論文60余篇。為中國營(yíng)養學(xué)會(huì )營(yíng)養與組學(xué)技術(shù)分會(huì )副主任委員、上海市生物物理學(xué)會(huì )理事、中國遺傳學(xué)會(huì )終身會(huì )員及多個(gè)期刊編委。主要學(xué)術(shù)貢獻為：創(chuàng )建采用全基因組數據估計群體進(jìn)化歷史后再檢測正選擇的校準型經(jīng)典方法體系；揭示祖先群體可能比衍生群體更加遠離外群，糾正教科書(shū)中一個(gè)重要錯誤；創(chuàng )建從非平衡溯祖樹(shù)檢測正選擇的理論體系，提高檢測精確度；將人工智能引入群體遺傳學(xué)，成功檢測正選擇，并建立迄今為止最為精確的人類(lèi)遺傳重組圖譜；創(chuàng )建用聯(lián)合突變頻譜估計多群體進(jìn)化歷史的新方法；圍繞中科院先導任務(wù)組隊進(jìn)行攻關(guān)，開(kāi)發(fā)綜合分析免費軟件eGPS，助力大數據深度挖掘；發(fā)展正選擇檢測新方法，精準定位非編碼區的社會(huì )增強子PAS1，揭示PAS1-Lhx2對羊膜動(dòng)物社會(huì )階層形成的關(guān)鍵作用，并且突變PAS1可反轉社會(huì )階層，揭示社會(huì )階層如何通過(guò)演化出現；創(chuàng )立快速極小時(shí)間溯祖新理論，首次獲得任意群體模型下突變頻率頻譜的解析解，發(fā)現90萬(wàn)年前舊石器時(shí)代人類(lèi)曾面臨滅絕的威脅，解釋非洲人類(lèi)化石的重要缺失環(huán)節。詳細情況介紹請參考http://www.sinh.cas.cn/rcdw/qtyjzz/201803/t20180327_4986742.html。
高瑩研究員，研究方向為營(yíng)養分子流行病學(xué)，目前主要研究脂肪酸攝入和代謝在代謝紊亂、癌癥和生長(cháng)發(fā)育中的作用；尋找可以和營(yíng)養因素共同影響疾病危險性的表觀(guān)遺傳因素以第一作者和通訊作者身份在Gastroenterology, International Journal of Cancer, American Journal of Clinical Nutrition, Journal of Nutrition, British Journal of Nutrition 等期刊發(fā)表SCI論文30余篇；擔任Journal of Nutritional Biochemistry 編輯。詳細情況介紹請參考http://www.sinh.cas.cn/rcdw/qtyjzz/201803/t20180328_4987324.html 。
黃濤青年研究員，研究方向為生物醫學(xué)大數據的機器學(xué)習和網(wǎng)絡(luò )分析。曾在美國紐約西奈山伊坎醫學(xué)院從事博士后研究。目前擔任中國科學(xué)院青年創(chuàng )新促進(jìn)會(huì )生命分會(huì )副會(huì )長(cháng)。發(fā)表論文100余篇，累計引用超過(guò)1萬(wàn)次，連續多年入選Elsevier中國高被引學(xué)者和全球前2%頂尖科學(xué)家榜單。主持或參與國家自然科學(xué)基金委項目、國家重點(diǎn)研發(fā)計劃、中國科學(xué)院先導科技專(zhuān)項、上海市自然科學(xué)基金項目、國際人類(lèi)表型組計劃等國家及省部級研究項目10余項。詳細情況介紹請參考http://www.sinh.cas.cn/rcdw/qtbssds/202203/t20220310_6387862.html ；近期研究論文詳見(jiàn) https://scholar.google.com.hk/citations?hl=en&user=N6meTgoAAAAJ 。
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